1、遗传因子：基因的最初概念来自孟德尔的“遗传因子”，认为生物性状的遗传是由遗传因子所控制的，性状本身是不能遗传的，被遗传的是遗传因子。

2、基因是一个遗传、交换、突变的单位：1910年摩尔根等通过果蝇杂交实验表明，染色体在细胞分裂时的行为与基因行为一致，从而证明基因位于染色体上，并呈直线排列，提出了遗传学的连锁交换规律，证明了性别决定是受染色体支配的。

3、基因是不可分割的功能单位：1944年Avery等人我生物化学方法证明了DNA就是遗传物质。G W．Beadle和E．L．Tatum通过对粗糙脉孢菌营养缺陷型的研究，提出了一个基因一个酶的假说。

4、基因是一个转录单位：50年代初，美国遗传学家B．McClintock在玉米的控制因子的研究中已经指出某些遗传因子是可以转移位置的。