上海主要有三所医科大学，分别如下：

上海交通大学医学院：由中华人民共和国教育部、中华人民共和国卫生部和上海市人民政府共建。上海交通大学医学院前身是由圣约翰大学医学院、震旦大学医学院、同德医学院于1952年全国高等学校院系调整时合并而成的上海第二医学院；1985年，更名为上海第二医科大学。上海中医药大学：创办于1956年，是我国首批建立的四所中医高等院校之一，学校集教学、医疗、科研于一体，专业设置齐全，师资力量雄厚，综合实力位居全国中医院校前列，下设16个二级学院。中国人民解放军第二军医大学：创建于1949年9月，1951年定名为“中国人民解放军第二军医大学”，隶属中国人民解放军总后勤部。