二本院校和三本院校的区别如下：

1、入取批次不同：一本为第一批次、二本为第二批次、三本为第三批次；

2、收取的学费不同：一本、二本少些，一些转设二本学费相对稍高，三本院校学费相对更高；

3、范畴不同：一本是“公办范畴”的，二本大多数是“公办范畴”的，有极少数属于“民办范畴”的。三本主要是指“独立学院本科院校”等，是“公办民助范畴”的。