上海复旦大学参股的上市企业有中国高科（600730）和复旦复华（600624）。

中国高科集团股份有限公司是由全国174所高等院校及单位投资入股组建的新型高科技企业。从事生物医药、电子、通讯等高新技术领域的实业投资、创业投资及国内外贸易。

2016年1月11日，公司控股股东方正集团通过上海证券交易所交易系统增持公司部分股份，增持数量为102，984股，占公司总股本的0.02%，增持金额为1，586，880.31元。本次增持前，方正集团持有公司股票数量为117，380，000股，占公司总股本的20.01%。

上海复旦复华科技股份有限公司是一家主营医药、软件与园区房产等所属行业为综合类的公司。公司主要从事：电脑系统、通讯设备、自动化仪表、生物技术、光源照明等产品的研制及生产销售。

截至2018年12月31日止，本公司累计发行股本总数68，471.2010万股，注册资本为68，471.2010万元。