公司是由股东出资设立的，股东是公司的所有人，所以被收购的公司资金如何分配，由被收购公司的股东共同决定。

【法律依据】

《公司法》第三十六条：有限责任公司股东会由全体股东组成。股东会是公司的权力机构，依照本法行使职权。