学校拖欠工程款可以先通过电话和函件催收，亲自到学校上门催收，其次，委托律师代为催收，最后如果实在不行就向法院申请起诉处理。

根据《劳动合同法》第30条规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。