工资指导线的备案流程是：

1、企业梳理上年度工资指导线实施方案履行情况，内容包括上年度职工发放工资及增长幅度、发放工资及增长幅度未达到的原因。

2、企业根据政府发布的工资指导线，采用工资集体协商的方式，就劳动定额标准、计件单价、工资分配制度和办法、工资调整幅度及工资水平等内容进行协商。

3、制定本年度工资指导线实施方案。

【法律依据】

《劳动法》第四十六条，工资分配应当遵循按劳分配原则，实行同工同酬。工资水平在经济发展的基础上逐步提高。国家对工资总量实行宏观调控。