民间借贷公司破产债权的处理由清算组会计师对破产企业的应收帐款进行审计，并编制成册。由清算组律师根据该应收款帐册，通过与破产企业法定代表人或知情人的谈话，了解每笔应收帐款的形成过程和证据情况。由清算组律师根据审计报告以及相关证据，起草破产企业对外债权确认报告，提交法院。

【法律依据】

《企业破产法》第四十四条规定，人民法院受理破产申请时对债务人享有债权的债权人，依照本法规定的程序行使权利。