1、去国地税，申请农业专业合作社免税备案，按合作社农产品的性质，肉，蛋，菜是免所得税和增值税的，水产类的减半，凡是合作社的都免。

2、申请一般纳税人，合作社申请了免税之后，只可以开普通发票，发票上的税率为0。不这个发票是可以作为进项发票的，用途跟专用发票一个性质。国家是有政策的。

3、对所有社员建立个人账户。日后社员分红时必需要用的。

4、社员之间与合作社的交易，是不需要发票的，开具入库单和出库单即可。

5、合作社与客户的交易，开具发票，并写入库单，一般价格如果由社员来定，是社员价格加合作社服务费等于收款金额。