主要区别是，意思不同、侧重点不同、引证解释不同，具体如下：

一、意思不同

1、合伙

是两人或者两人以上的群体，发挥各自优势，一同去做一些可以给其带来经济利益的事情。

2、合作

指共同创作，共同从事，二人或多人一起工作以达到共同目的，联合作战或操作。

二、侧重点不同

1、合伙

共同，一起。

2、合作

联合作战或操作。

三、引证解释不同

1、合伙

《文汇报》1986.6.14：“有人说六必居原来是六个人合伙开的一家小酒店。”

2、合作

丁玲《在医院中》二：“她并不喜欢这种人，也不需要这种人做朋友，可是在工作上她是乐意和这人合作的。”