成熟的木瓜果肉很软，不易保存，购回后要立即食用。若买后不打算立即食用，建议选择尚未全黄略带青色为优，待回家后摆放1至2天，再以报纸包好放入冰箱冷藏，至多可以保存约4至5天。

成熟度在六成以上：最好快吃、如果吃不完就煮糖水或煲骨头汤放冰箱可放三天.

成熟度在五成以下：用保鲜袋套好，放在冰箱也可放三天。此外也可以刨成片或丝放一些糖醋做成酸料保存，慢慢吃。