北京南站没有吸烟室。《北京市控制吸烟条例》第九条规定，公共场所、工作场所的室内区域以及公共交通工具内禁止吸烟，所以北京南站没有吸烟室的。

2015年6月1日，北京全面施行禁烟令，除了所有公共场所、工作场所室内区域及公共交通工具禁止吸烟外，部分室外场所也被列入禁烟范围。违反禁令的烟民，最高罚款200元，堪称“史上最严的禁烟令”。