乙酸乙酯毒性很微。大鼠经口LD50为5600MG/KG。但对粘膜有中等程度的刺激作用。人在高浓度接触时可引起眼、鼻、咽喉和呼吸道刺激症状，严重时会出现进行性的麻醉作用，操作场所最高允许浓度为1400MG/M3。