近亲繁殖有两种坏的可能性，一种可能性是鱼身上的颜色褪去；另一种可能性是基因恶化，后代的鱼会越来越小。但是近亲鱼繁殖也有一个优点就是可以纯化优良基因。很多新品种的凤尾鱼都是用这种方式培育出来的，不过这种提纯一般要优化至少3代以上才能保持住基因。