工程师助理的主要工作内容有：1、在项目经理领导下，负责本项目的全面技术管理工作；2、主持设计文件审核，主持复测、控测及竣工测量，督促并检查工点技术人员作好技术交底工作；3、负责编制本标段的施工组织设计，参与重大方案的制定，审核单项工程的施组。工程师助理是初级工程技术人员的职务名称，指符合国家相关规定，通过相关考试和国家相关部门评审，取得相应的任职资格的人员。