健康证不是全国通用，在本省通用。一般来说是以省、自治区或直辖市划分的，所以市、县卫生行政部门所出具的健康证在本省内没问题，但跨省时因为每个地方法规的具体执行不同，可能产生偏差。

《中华人民共和国传染病防治法》第五条

各级人民政府领导传染病防治工作。县级以上人民政府制定传染病防治规划并组织实施，建立健全传染病防治的疾病预防控制、医疗救治和监督管理体系。

第六条

国务院卫生行政部门主管全国传染病防治及其监督管理工作。县级以上地方人民政府卫生行政部门负责本行政区域内的传染病防治及其监督管理工作。县级以上人民政府其他部门在各自的职责范围内负责传染病防治工作。军队的传染病防治工作，依照本法和国家有关规定办理，由中国人民解放军卫生主管部门实施监督管理。