帝企鹅身披黑白分明的大礼服，喙赤橙色，脖子底下有一片橙黄色羽毛，向下逐渐变淡，耳朵后部最深，全身色泽协调。  颈部为淡黄色，耳朵的羽毛为鲜黄桔色，腹部乳白色，背部及鳍状肢则是黑色，鸟喙的下方是鲜黄桔色。雄皇帝企鹅双腿和腹部下方之间有一块布满血管的紫色皮肤的育儿袋，能让蛋在环境温度低达零下40℃的低温中保持在舒适的36℃。小帝企鹅身上的浅灰白色绒羽可御寒防风，但不防水，防水的鳞羽要等到它们快成年时才会长出，慢慢替换身上的绒羽，身体下方的绒羽会先掉。

从外观看，各种企鹅都很可爱，形态差不多。但事实上它们之间还是存在差异。帝企鹅与王企鹅常被混为一谈，它们实际是不同的两类。帝企鹅和王企鹅很相象，它们都身披黑白分明的大礼服，喙部赤橙色，脖子底下有一片橙黄色羽毛，向下逐渐变淡。不同之处在于，帝企鹅身材比王企鹅大，耳部是黄色的。