应该扣30元的个人所得税。

应纳个人所得税税额=应纳税所得额×适用税率-速算扣除数。

2019年开始个人所得税的起征点为5000元。应纳税所得额=工资-起征点，即1000元。适用税率目前为10%，本级速算扣除额=上一级最高所得额×（本级税率-上一级税率）+上一级速算扣除数，即30元。