如果你是交通运输企业，则可以开具运输发票，否则不可以。即使你把帮客户运输的费用单独开票，也要作为你销售货物的价外收入，计算增值税。

抵扣，原则上是可以的。如果你是委托外单位帮你运输，你支付运费取得的运费发票，则可以按运费总额（含运费、建设基金，但不含装卸费、保险费等杂费）的金额按7%计算扣除。