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从三大类别看“泛癌症图谱”研讨效果

发布者:李楠华
导读日前,由美国国立卫生研讨院(NIH)赞助的“泛癌症图谱”(PanCancer Atlas)项目初次发布了研讨效果:研讨人员完成了来自33种不同类型肿瘤的1.1万例患者详细的肿瘤基因测序及剖析。“绘制”出了局部癌症片面、多维的基因组变化图谱。NIH院长Collins博士以为,正如业界所期盼的那样,该项效果可谓是十多年来创始性癌症研讨的“巅峰之作”!该项研讨成功地为肿瘤专家和临床医生片面而透彻地诠释了
从三大类别看“泛癌症图谱”研究成果

日前,由美国国立卫生研讨院(NIH)赞助的“泛癌症图谱”(PanCancer Atlas)项目初次发布了研讨效果:研讨人员完成了来自33种不同类型肿瘤的1.1万例患者详细的肿瘤基因测序及剖析。“绘制”出了局部癌症片面、多维的基因组变化图谱。

NIH院长Collins博士以为,正如业界所期盼的那样,该项效果可谓是十多年来创始性癌症研讨的“巅峰之作”!

该项研讨成功地为肿瘤专家和临床医生片面而透彻地诠释了癌症发病机理,包括癌症如何发作、生长部位以及为何发作?与此同时,也有助于今后更好地搜集抗癌药物临床实验数据信息和将来精准医治方案的选择。

具里程碑意义的“TCGA”

泛癌症图谱的研讨效果以27篇论文集方式宣布在著名期刊《Cell》上。也是对已完成的癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas , TCGA)的进一步补充和总结。

“TCGA”项目是由美国国度人类基因组研讨所(NHGRI)和美国国度癌症中心(NCI)结合发起并支持的多中心协作项目,这两家牵头机构从属于NIH。“TCGA”项目经费多达3亿美元,包括北美20多家机构的150名科研人员参与项目。

“TCGA”作为国际癌症基因组联盟机构最大的研讨项目,也是肿瘤转化研讨范畴最大的数据库。

NHGRI基因组学部主任兼TCGA项目担任人Hutter博士以为,“TCGA”是第一个精准研讨项目,在基因分子程度上片面总结了多种癌症特征。

10年前,该项目启动时还处于起步阶段,搜集的数据缺乏以支撑如此大规模的根底研讨,以致于无法在基因分子程度上给各类癌症“画像”以及剖析其机理。这在事先也是颇具野心的雄伟方案。

NCI——TCGA项目担任人Zenklusen博士指出“泛癌症图谱”旨在补充过来10年来基于“TCGA”项目研讨效果宣布的30多篇与肿瘤相关的论文,并且最终拓展了2013年晚期宣布的“泛癌症研讨报告”。

“泛癌症图谱”回到当下汹涌澎湃的AI浪潮,正如所有的企业都被互联网化一样,所有的互联网企业都将 AI 化。而这些互联网企业中,也包含CSDN。同时,作为全球最大的中文IT社区,CSDN还有一个历史使命——为广大的互联网公司进行AI赋能。项目不只关注癌症基因组测序,还关注不同类型数据的比照剖析,例如研讨基因与蛋白质表达谱,并将其与临床表观和影像反省数据停止关联性比照。

三品种别研讨效果

泛癌症图谱项目被分为三大类别,每品种别都由一篇总结性阐述对其中心内容停止概括和引申讨论,中心主题内容包括:癌细胞来源、致癌进程和途径以及癌细胞信号传导通路等。多篇同期论文宣布了对三大类别中的其他主题也停止了深化发掘和讨论其研讨效果。

在第一篇阐述中,作者经过使用分子聚类剖析技术,对基因测序后果剖析停止总结。此剖析技术次要是经过设置基因表达、癌症细胞染色体数目异常和DNA修饰等参数来对癌症停止分组(分类)。

此篇阐述的研讨后果标明,癌症类型是由其能够的来源细胞决议。此结论加深了我们对癌症组织来源影响癌症特征的看法,便于我们针对各种癌症类型采取更恰当和精准的临床医治方案。

第二篇阐述概述了“TCGA”在招致癌症开展和停顿进程中的重要效果。作者特别指动身现了三个关键性“致癌要素”:

渐变,包括胚系渐变(遗传性)和体细胞渐变(取得性);

癌症的潜在基因组和表观基因组对基因和蛋白表达的直接和直接影响;

癌症和免疫细胞的互相作用。

这些研讨效果将有助于为各种癌症的创新疗法和免疫疗法排序出使用的优先级别。

最初一篇阐述详细引见了“TCGA”对控制细胞周期、细胞死亡和细胞生长信号通路基因组改动的研讨,提醒了这些进程在一系列癌症中的异同。这些可以效果也提醒了癌症发作开展中所存在的缺陷。这将有助于开发结合疗法和特性化医疗方案。

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